Depuis juin 2022, Geomatys est titulaire du label CNES PME pour une durée de trois ans, en récompense de son expertise en « standardisation de système d’information géospatiaux interopérables ». Attribué depuis 2020, et comme son nom l’indique, ce label est attribué aux PME innovantes et crédibles agissant dans le domaine du spatial.